Détection de la rage à l'ACIA : échantillons humains

Pour obtenir une version imprimable en format PDF des documents d'orientation sur la détection de la rage, veuillez consulter l'Association canadienne des médecins vétérinaires : Directives sur la rage.

Sur cette page 

Processus de soumission d'échantillons humains

Enquête sur la maladie et facteurs à prendre en compte

  • Encéphalite de cause indéterminée, détérioration rapide, hospitalisation
  • Morsure d'animal ou historique de contact
  • Voyage dans un pays ou une région où la rage terrestre est enzootique, par exemple la rage des chiens en Afrique ou Asie

Communiquer avec le Laboratoire d'expertise sur la rage de l'ACIA à Ottawa

  • Après consultation avec l'hôpital concernant les types d'échantillons et l'urgence des tests, l'ACIA organise la disponibilité du personnel pour les tests spécialisés, y compris les heures supplémentaires, si nécessaire.
  • L'ACIA fournit la documentation requise à l'hôpital, y compris le Formulaire de soumission d'échantillon pour la détection de la rage, ainsi que toutes les instructions spéciales.

Remplir le formulaire de soumission

  • Un seul formulaire par patient, même si plusieurs échantillons sont envoyés pour des tests.
  • Remplir le Formulaire de soumission et l'envoyer au laboratoire par courriel. Consultez remplir le formulaire de soumission pour plus d'informations.

Emballage et expédition au laboratoire

  • L'hôpital collecte les échantillons requis (biopsie cutanée nucale, échantillons de salive).
  • Emballez les échantillons, incluez une copie imprimée du formulaire et organisez l'expédition au laboratoire. Consultez directives pour l'envoi d'échantillons pour plus d'informations.
  • Complétez et envoyez par télécopieur ou courriel la page de notification (Comment demander la soumission d'un échantillon humain) pour informer le laboratoire des détails de l'expédition.
  • Suivre l'expédition jusqu'à ce qu'elle arrive et un courriel « Notification de réception d'échantillons de la rage » est reçu de l'ACIA.

Analyse des échantillons et rapport des résultats

  • Lorsque l'échantillon est reçu à l'ACIA, un avis par courriel indiquant que l'échantillon est « En cours d'essai » sera envoyé à l'envoyeur.
  • L'ACIA effectue des tests diagnostiques (le nombre et le type de tests dépendent des échantillons reçus) et autorise la diffusion des résultats des tests.
  • L'ACIA communique les résultats par téléphone à l'envoyeur inscrit sur le formulaire de soumission d'échantillons pour la rage lorsque les tests sont terminés.
  • Le « Rapport d'analyse » officiel pour tous les échantillons sera envoyé par courriel à toutes les adresses fournies par l'envoyeur sur le formulaire au fur et à mesure que les tests sont terminés.
  • Si le virus de la rage est détecté, un typage des variants est effectué et les résultats sont communiqués à l'envoyeur.
  • L'hôpital informe l'ACIA si des tests supplémentaires sont nécessaires (par exemple, test d'échantillons supplémentaires; surveillance de la charge virale dans la salive)

Cas de rage humaine au Canada

Les cas de rage humaine sont rares au Canada. Depuis 1924, seuls 25 cas ont été documentés. Le dernier cas déclaré de rage humaine contractée au pays à cause d'un mammifère terrestre remonte à 1967 à Richmond (Ontario). Depuis ce temps, tous les cas, sauf deux, ont été causés par une chauve-souris. Dans les deux autres cas (1984 et 2012), la maladie a été contractée dans les Caraïbes, par une morsure par un chien.

Les programmes de vaccination orale et les autres stratégies ciblant des espèces terrestres précises ont été efficaces pour lutter contre la rage (et, dans certains cas, l'éliminer) dans certaines provinces canadiennes. Cependant, ce ne sont pas toutes les provinces qui ont un programme de lutte contre la rage chez la faune sauvage, et la lutte contre la rage chez la chauve-souris n'est pas possible.

Même si la chauve-souris est porteuse de ses propres variants du virus de la rage, les chauves-souris infectées peuvent transmettre le virus à d'autres mammifères. Ces cas de transmission sont appelés « débordements » ou « transmission inter-espèces ». Plusieurs cas de débordements de chauves-souris à des animaux domestiques sont signalés chaque année au Canada; ces cas comportent un risque de transmission aux humains. Ainsi, il existe encore au Canada un risque d'exposition à la rage à cause des animaux, même en l'absence d'épizootie connue chez des mammifères terrestres.

En plus d'un tableau clinique correspondant à celui de la rage, d'autres facteurs sont importants dans l'évaluation du risque rabique. Fournissez au laboratoire autant de renseignements que possible afin de faciliter la sélection des réactifs appropriés pour le diagnostic de la rage et le typage du virus.

Considérations premières dans les cas suspects de rage

Antécédents de voyage du patient

Un voyage dans un pays où la rage est endémique, en particulier chez le chien, doit être considéré comme un facteur de risque pour la transmission de la rage, même en l'absence d'exposition connue à un vecteur de la rage. Étant donné que la maladie peut aussi être causée par des Lyssavirus apparentés, par exemple le Lyssavirus de la chauve-souris australienne, les voyages dans des pays indemnes de rage peuvent tout de même constituer un facteur de risque. Le laboratoire de l'ACIA peut vous informer sur la répartition du virus de la rage et d'autres Lyssavirus au Canada et à travers le monde.

Expositions potentielles au virus de la rage

La période d'incubation de la rage humaine est habituellement d'un à 3 mois, mais peut aller de 10 jours à plus d'un an. Un contact récent ou ancien avec des chauves-souris ou d'autres mammifères constitue un facteur de risque d'infection par le virus de la rage, en particulier dans les régions où la maladie est endémique. Une exposition de catégorie III est définie comme une ou plusieurs morsures ou égratignures transdermiques, une peau éraflée léchée par un animal, ou l'infection d'une membrane muqueuse par de la salive. Une exposition de catégorie II est définie comme le fait de se faire mordiller la peau nue ou de subir des égratignures ou des abrasions mineures, sans saignement. Les 2 types d'exposition peuvent occasionner la transmission du virus d'un animal infecté à un humain.

Tests offerts au Laboratoire d'expertise sur la rage de l'ACIA

Au Laboratoire de santé animale d'Ottawa – Fallowfield (LOF), les diagnostics de rage humaine peuvent être faits au moyen des épreuves suivantes :

  • immunofluorescence (IF) sur une biopsie de la peau nucale (ante-mortem)
  • sur des tissus cérébraux (post-mortem)
  • transcription inverse suivie de la réaction en chaîne de la polymérase (RT-PCR) sur la peau, la salive ou un tissu cérébral

On procède également au typage du variant du virus par l'analyse de la séquence génétique ou par utilisation de séries d'anticorps monoclonaux. L'ACIA n'effectue pas d'épreuve sérologique pour déceler les anticorps du virus de la rage. Pour les tests sérologiques, communiquez avec l'Agence de la santé publique du Canada (ASPC).

Biopsie de la peau nucale (ante-mortem)

La peau de la nuque contient de nombreux follicules pileux hautement innervés. On peut détecter l'antigène du virus de la rage, ante-mortem, par immunofluorescence s'il y a eu propagation du virus en périphérie.

Faites une biopsie profonde d'au moins 5 mm et contenant plusieurs follicules pileux. Placez une gaze humide dans un contenant avec les tissus prélevés, sans les envelopper. Conservez à une température de 4 °C ou – 20 °C jusqu'au moment de l'expédition.

Au laboratoire, la peau est congelée et sectionnée à l'aide d'un cryostat, et plusieurs coupes sont analysées par immunofluorescence. Des épreuves de RT-PCR peuvent aussi être faites.

Si on décèle des antigènes du virus de la rage, on extraira l'ARN viral de la peau qui reste, et on déterminera le variant du virus par séquençage. Pour ces raisons, il est important d'envoyer une biopsie de bonne taille, pour que les différentes épreuves puissent toutes être effectuées.

Salive (ante-mortem)

On peut envoyer des échantillons de salive pour les faire analyser par RT-PCR classique ou en temps réel. Placez 2 à 3 ml de salive directement dans un tube stérile ou aspirez-la et déposez-la dans un contenant stérile étanche. N'ajoutez pas d'agent de conservation ni d'autre matériel. Congelez immédiatement à – 20 °C, ou moins, pour empêcher la dégradation de l'ARN viral.

Des échantillons en série prélevés à au moins 12 heures d'intervalle, et préférablement 24 heures, augmenteront la sensibilité de l'épreuve, car l'excrétion du virus de la rage peut être intermittente au cours des premières étapes de la maladie.

La présence de bile ou de sang peut fausser les résultats. Cependant, si les seuls échantillons disponibles sont ainsi contaminés, envoyez-les quand même au laboratoire, qui tentera de les traiter.

Cas de rage diagnostiquée et surveillance de la charge virale

Lorsqu'on administre à un patient infecté par la rage des soins médicaux dans le but de le maintenir en vie, on peut demander au laboratoire de faire les épreuves afin de surveiller la charge virale dans la salive.

Prélevez les échantillons au moins toutes les 24 heures. Indiquez clairement la date et l'heure du prélèvement sur chaque tube.

Les résultats seront exprimés en unités d'équivalence de dose infectante pour des cellules en culture par ml de salive. La valeur d'unités d'équivalence est déterminée par interpolation des résultats de l'épreuve dans une courbe étalon de dilutions de concentrations connues du virus de la rage.

Examen post-mortem des tissus du système nerveux central

Les tissus cérébraux envoyés aux fins d'analyse doivent être frais (non fixés). Une petite section (1 cm x 1 cm x 1 cm) de tronc cérébral suffit pour un diagnostic. Vous pouvez envoyer des tissus additionnels, par exemple des tissus du cervelet, de la protubérance annulaire, du bulbe rachidien, de l'hippocampe et de la moelle épinière. N'envoyez pas que des tissus provenant du cortex cérébral, car ces tissus contiennent habituellement de moins grandes concentrations d'antigènes du virus de la rage que ceux des autres parties de l'encéphale.

Placez les tissus dans un contenant étanche pour qu'ils ne soient pas endommagés durant le transport. Conservez l'échantillon à 4 °C ou moins jusqu'au moment de l'expédition.

Au laboratoire, les tissus seront examinés par immunofluorescence. Si on y décèle l'antigène du virus de la rage, on procèdera au typage du virus par analyse avec une série d'anticorps antirabiques spécifiques ou par séquençage génétique.

Résumé des échantillons pour les tests ante-mortem

  • Aucun test ante mortem unique n'est suffisant pour « exclure » la rage.
  • Si les symptômes sont apparus <7 jours plus tard, un résultat de test négatif n'exclut pas l'infection par le virus de la rage car l'excrétion peut être intermittente et la réponse en anticorps peut être négligeable.
Échantillons Biopsie de la peau nucale Salive Liquide céphalorachidien
Recommandé pour le diagnostic? Oui Oui Non
Prélèvement Biopsie de pleine épaisseur de la peau, d'au moins 5 mm de diamètre, comprenant plusieurs follicules pileux. Plusieurs prélèvements à intervalle d'au moins 12 heures, 2 à 3 ml par échantillon. 1 ml
Contenant Récipient à échantillon stérile avec gaze humidifiée à côté du tissu.
NE PAS envelopper le tissu.
Tube ou fiole stérile.

Aucun agent de conservation.
Tube ou fiole stérile.
Température de conservation -20°C jusqu'à 4°C -20°C ou plus froid -20°C ou plus froid
Tests Immunofluorescence

RT-PCR en temps réel
RT-PCR en temps réel RT-PCR en temps réel
Notes Plusieurs analyses sont effectuées, envoyez des biopsies de taille suffisante. La présence de bile ou de sang peut fausser les analyses. Les échantillons sont souvent IMPROPRES en raison de l'absence ou du manque d'AND du patient, lequel sert de témoin pour les analyses. Contacter ASPC pour les tests de sérologie.

Consultez les pages suivantes pour plus d'informations :

Comment demander la soumission d'un échantillon humain pour la détection de la rage

Pour soumettre des échantillons humains, vous devez aviser le laboratoire par téléphone au (343) 212-0340. Le laboratoire peut fournir une copie PDF du formulaire pour l'envoi d'échantillons humains pour la détection de la rage, ou vous pouvez télécharger une copie à partir du site Web de l'ACMV (consultez le document d'orientation « Échantillons humains&nbs;»).

Remplissez le formulaire fourni par le laboratoire et transmettez-le au laboratoire par télécopieur ou par courriel :

Veuillez fournir les renseignements suivants :

  • Nom de l'envoyeur
  • Service de messagerie ou compagnie aérienne
    • C'est l'expéditeur qui est responsable de choisir la méthode de transport et d'assurer la livraison de l'échantillon.
  • Numéro de suivi
  • Date et heure d'arrivée prévues
  • Indiquez si le patient a été hospitalisé
  • Date du début de la maladie
  • Décrivez les antécédents d'exposition de l'animal, le cas échéant
    • Inclure l'espèce et la nature de l'exposition, le cas échéant
  • Incluez les antécédents de voyage à l'extérieur de la province ou territoire de résidence, le cas échéant
    • Énumérez les provinces, les territoires et les pays, le cas échéant
  • Fournir des commentaires supplémentaires
  • Indiquez les échantillons envoyés (par exemple, salive, biopsie de la peau nucale, liquide céphalorachidien, tissus cérébraux ou de système nerveux centrale port-mortem)

Remplissez et soumettez un formulaire de soumission d'échantillon pour la détection de la rage. Joins une copie papier dans votre envoi d'échantillons.

Informations sur les options d'expédition des échantillons humains

Les informations ci-dessous s'appliquent uniquement aux échantillons humains.

 
Jour Fret aérien Messagerie Transport médical
Du lundi au vendredi

Le laboratoire organisera la prise en charge à l'aéroport.

Veuillez fournir les renseignements suivants à l'avance : Numéro de connaissement/de suivi, compagnie aérienne, numéro de vol, ainsi que la date et l'heure prévues d'arrivée.

Les grandes compagnies livrent sur notre site (par exemple, Purolator, FedEx, DHL, UPS) une fois par jour.

À l'heure actuelle, Purolator est la seule compagnie qui effectue régulièrement des livraisons à ce site avant 10 h. Les autres services de messagerie livrent tout au long de la journée jusqu'à 16 h, heure de fermeture de notre service de réception. Si vous souhaitez que des tests soient effectués le jour de la livraison, nous vous suggérons d'utiliser Purolator ou, après consultation avec le laboratoire, d'envoyer l'échantillon au dépôt (voir section suivante).

Le poste de garde de notre site accepte les colis tous les jours, de 6 h à minuit, y compris les fins de semaine et les jours fériés, toute l'année.
Samedi Même chose que du lundi au vendredi.

Certains services de messagerie, sur demande spéciale, livreront le samedi. Pour une livraison le samedi, veuillez expédier au dépôt du service de messagerie. Pour accélérer le traitement, le laboratoire organisera la collecte au dépôt, s'il est informé à l'avance.

Changer l'adresse de livraison en « DÉPÔT » et inclure l'adresse de la rue du dépôt du service de messagerie.

Marquez le colis « RAMASSAGE PAR LE CLIENT ».
Si l'expédition a lieu le vendredi, et pour s'assurer que l'échantillon arrive le samedi, cochez « SAM/ SAT » sur le connaissement électronique.

Ne sélectionnez pas « LIVRAISON AVANT 9 OU 10 H », car cette option s'applique uniquement au service de livraison régulier du lundi au vendredi. Si cette option est sélectionnée, cela peut entraîner une livraison le jour ouvrable suivant et l'échantillon peut ne pas être disponible pour le ramassage.

Utilisez le numéro de suivi du service de messagerie pour vérifier que le colis a été récupéré au dépôt par l'ACIA.

Même chose que du lundi au vendredi.
Dimanche et jours fériés Vérifiez auprès de la compagnie aérienne pour vous assurer que le bureau de fret est ouvert pour les ramassages de colis.

Aucun service n'est disponible le dimanche ou les jours fériés auprès de n'importe quel transporteur pour la livraison à cet endroit.

Pour les jours fériés du gouvernement canadien (le 11 novembre et le lundi de Pâques), les livraisons ne sont pas acceptées, donc les services de messagerie ne se rendront pas sur le site même s'ils sont ouverts. Si vous souhaitez qu'un échantillon soit testé ces jours-là, veuillez-vous référer aux instructions pour l'expédition au dépôt.

Pour la fête provinciale de la famille en février, le laboratoire est ouvert, mais les services de messagerie sont fermés.

Même chose que du lundi au vendredi.

Coordonnées

R-Unit, Laboratoire d'Ottawa Fallowfield
Agence canadienne d'inspection des aliments
3851, chemin Fallowfield
Ottawa ON K2J 4S1

Heures d'activité : lundi au vendredi 8 à 16h HE
Tél : 343-212-0340
Fax : 343-212-0202
Adresse de courriel : cfia.rabieseast-rageest.acia@inspection.gc.ca