L'Agence canadienne d'inspection des aliments est dirigée par un président qui relève de la ministre de la Santé et qui travaille en étroite collaboration avec le ministre de l'Agriculture et de l'Agroalimentaire.
Haute direction
- Paul MacKinnon, président
- Administratrice et administrateur en chef
Responsables de direction générale
- Diane Allan, vice-présidente associée, Politiques et programmes
- Kristine Allen, directrice exécutive et avocate générale principale, Services juridiques
- Debbie Beresford-Green, vice-présidente, Opérations
- Jane Hazel, vice-présidente, Communications et Affaires publiques
- Robert Ianiro, vice-président, Politiques et programmes
- César Kagame, ombuds
- Christine Moran, sous-ministre adjointe et vice-présidente, Affaires internationales
- David Nanang, vice-président, Sciences
- Scott Rattray, inspecteur général et dirigeant principal de la vérification
- Raman Srivastava, vice-président, Ressources humaines et Services numériques
- Stanley Xu, vice-président, Gestion intégrée, dirigeant principal des finances et dirigeant principal de la sécurité
Postes de direction au sein du Bureau du président
- Linda Nguyen, chef de cabinet
- Tanya Day, liaison ministérielle (Santé Canada et Agriculture et Agroalimentaire Canada)